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xml-pipeline/
├── agentserver/
│   ├── auth/
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── totp.py
│   ├── config/
│   │   ├── organism_identity/
│   │   │   └── README.txt
│   │   └── __init__.py
│   ├── listeners/
│   │   ├── examples/
│   │   │   ├── __init__.py
│   │   │   └── echo_chamber.py
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── base.py
│   ├── privileged/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── commands.py
│   │   ├── models.py
│   │   └── msg_listener.py
│   ├── schema/
│   │   └── priviledged-msg.xsd
│   ├── utils/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── logging_setup.py
│   │   └── xml_tools.py
│   ├── __init__.py
│   ├── agentserver.py
│   ├── llm_connection.py
│   ├── main.py
│   └── message_bus.py
├── scripts/
│   └── generate_organism_key.py
├── tests/
│   └── __init__.py
├── LICENSE
├── README.md
├── __init__.py
├── pyproject.toml
├── roadmap.md
├── setup-project.ps1
└── structure.md
```